Protein–RNA interactions for Protein: Q06180

Ptpn2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn2Q06180 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn2Q06180 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptpn2Q06180 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn2Q06180 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn2Q06180 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn2Q06180 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptpn2Q06180 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn2Q06180 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn2Q06180 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptpn2Q06180 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn2Q06180 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn2Q06180 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptpn2Q06180 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn2Q06180 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn2Q06180 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn2Q06180 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn2Q06180 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn2Q06180 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn2Q06180 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn2Q06180 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn2Q06180 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms