Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk18Q04899 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk18Q04899 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk18Q04899 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk18Q04899 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk18Q04899 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk18Q04899 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk18Q04899 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk18Q04899 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk18Q04899 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk18Q04899 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk18Q04899 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk18Q04899 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk18Q04899 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk18Q04899 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk18Q04899 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk18Q04899 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk18Q04899 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk18Q04899 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk18Q04899 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk18Q04899 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk18Q04899 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk18Q04899 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms