Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfdP97946 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfdP97946 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfdP97946 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfdP97946 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfdP97946 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfdP97946 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfdP97946 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfdP97946 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfdP97946 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VegfdP97946 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VegfdP97946 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VegfdP97946 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfdP97946 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfdP97946 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VegfdP97946 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VegfdP97946 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VegfdP97946 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VegfdP97946 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VegfdP97946 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VegfdP97946 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VegfdP97946 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfdP97946 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfdP97946 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfdP97946 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfdP97946 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfdP97946 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfdP97946 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfdP97946 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfdP97946 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfdP97946 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfdP97946 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfdP97946 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfdP97946 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfdP97946 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms