Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cited1P97769 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cited1P97769 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cited1P97769 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cited1P97769 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cited1P97769 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cited1P97769 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cited1P97769 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited1P97769 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited1P97769 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited1P97769 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms