Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TgfbiP82198 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TgfbiP82198 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TgfbiP82198 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TgfbiP82198 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TgfbiP82198 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TgfbiP82198 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TgfbiP82198 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TgfbiP82198 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TgfbiP82198 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TgfbiP82198 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TgfbiP82198 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TgfbiP82198 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TgfbiP82198 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TgfbiP82198 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TgfbiP82198 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TgfbiP82198 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms