Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otx1P80205 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otx1P80205 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Otx1P80205 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otx1P80205 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otx1P80205 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otx1P80205 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Otx1P80205 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Otx1P80205 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otx1P80205 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otx1P80205 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otx1P80205 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otx1P80205 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otx1P80205 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otx1P80205 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otx1P80205 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otx1P80205 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otx1P80205 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otx1P80205 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otx1P80205 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otx1P80205 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otx1P80205 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otx1P80205 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otx1P80205 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otx1P80205 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Otx1P80205 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Otx1P80205 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otx1P80205 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Otx1P80205 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Otx1P80205 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otx1P80205 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms