Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc8a1P70414 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc8a1P70414 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc8a1P70414 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc8a1P70414 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc8a1P70414 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc8a1P70414 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc8a1P70414 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc8a1P70414 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc8a1P70414 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms