Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tp53bp1P70399 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tp53bp1P70399 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tp53bp1P70399 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tp53bp1P70399 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tp53bp1P70399 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tp53bp1P70399 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tp53bp1P70399 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tp53bp1P70399 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tp53bp1P70399 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tp53bp1P70399 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tp53bp1P70399 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tp53bp1P70399 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tp53bp1P70399 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tp53bp1P70399 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tp53bp1P70399 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tp53bp1P70399 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tp53bp1P70399 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tp53bp1P70399 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tp53bp1P70399 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tp53bp1P70399 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tp53bp1P70399 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tp53bp1P70399 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tp53bp1P70399 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tp53bp1P70399 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tp53bp1P70399 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tp53bp1P70399 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tp53bp1P70399 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms