Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Traf5P70191 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Traf5P70191 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Traf5P70191 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Traf5P70191 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Traf5P70191 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Traf5P70191 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Traf5P70191 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Traf5P70191 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Traf5P70191 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Traf5P70191 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Traf5P70191 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Traf5P70191 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Traf5P70191 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Traf5P70191 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Traf5P70191 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Traf5P70191 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Traf5P70191 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Traf5P70191 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Traf5P70191 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Traf5P70191 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Traf5P70191 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Traf5P70191 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Traf5P70191 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Traf5P70191 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Traf5P70191 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Traf5P70191 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Traf5P70191 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Traf5P70191 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Traf5P70191 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Traf5P70191 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Traf5P70191 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Traf5P70191 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Traf5P70191 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Traf5P70191 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Traf5P70191 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Traf5P70191 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Traf5P70191 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Traf5P70191 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Traf5P70191 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Traf5P70191 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Traf5P70191 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Traf5P70191 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Traf5P70191 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Traf5P70191 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Traf5P70191 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Traf5P70191 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Traf5P70191 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Traf5P70191 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms