Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ThraP63058 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ThraP63058 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ThraP63058 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ThraP63058 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ThraP63058 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ThraP63058 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ThraP63058 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ThraP63058 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ThraP63058 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ThraP63058 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ThraP63058 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ThraP63058 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ThraP63058 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ThraP63058 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ThraP63058 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ThraP63058 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ThraP63058 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ThraP63058 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ThraP63058 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ThraP63058 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ThraP63058 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ThraP63058 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ThraP63058 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ThraP63058 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ThraP63058 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ThraP63058 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ThraP63058 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ThraP63058 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ThraP63058 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ThraP63058 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ThraP63058 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ThraP63058 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ThraP63058 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ThraP63058 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ThraP63058 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ThraP63058 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ThraP63058 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ThraP63058 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ThraP63058 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ThraP63058 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ThraP63058 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ThraP63058 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ThraP63058 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ThraP63058 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ThraP63058 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ThraP63058 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ThraP63058 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ThraP63058 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ThraP63058 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ThraP63058 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ThraP63058 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ThraP63058 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ThraP63058 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ThraP63058 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ThraP63058 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ThraP63058 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ThraP63058 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ThraP63058 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ThraP63058 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ThraP63058 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ThraP63058 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ThraP63058 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ThraP63058 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ThraP63058 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ThraP63058 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ThraP63058 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ThraP63058 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ThraP63058 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ThraP63058 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ThraP63058 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ThraP63058 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ThraP63058 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ThraP63058 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ThraP63058 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ThraP63058 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ThraP63058 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ThraP63058 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ThraP63058 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ThraP63058 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ThraP63058 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ThraP63058 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ThraP63058 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ThraP63058 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ThraP63058 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ThraP63058 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ThraP63058 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ThraP63058 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ThraP63058 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ThraP63058 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ThraP63058 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ThraP63058 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ThraP63058 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ThraP63058 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ThraP63058 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ThraP63058 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ThraP63058 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ThraP63058 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ThraP63058 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ThraP63058 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms