Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdk5r1P61809 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk5r1P61809 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5r1P61809 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5r1P61809 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5r1P61809 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5r1P61809 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms