Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgf1P61148 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgf1P61148 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgf1P61148 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgf1P61148 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgf1P61148 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgf1P61148 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fgf1P61148 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fgf1P61148 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fgf1P61148 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fgf1P61148 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgf1P61148 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fgf1P61148 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgf1P61148 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgf1P61148 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgf1P61148 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgf1P61148 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgf1P61148 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgf1P61148 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgf1P61148 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgf1P61148 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgf1P61148 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgf1P61148 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgf1P61148 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgf1P61148 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgf1P61148 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgf1P61148 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgf1P61148 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgf1P61148 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.8 ms