Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hps5P59438 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hps5P59438 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hps5P59438 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hps5P59438 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hps5P59438 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hps5P59438 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hps5P59438 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hps5P59438 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hps5P59438 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hps5P59438 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hps5P59438 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hps5P59438 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Hps5P59438 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Hps5P59438 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Hps5P59438 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hps5P59438 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hps5P59438 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hps5P59438 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hps5P59438 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hps5P59438 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hps5P59438 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hps5P59438 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hps5P59438 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hps5P59438 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hps5P59438 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hps5P59438 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hps5P59438 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hps5P59438 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hps5P59438 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hps5P59438 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hps5P59438 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hps5P59438 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hps5P59438 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hps5P59438 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hps5P59438 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hps5P59438 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hps5P59438 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hps5P59438 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hps5P59438 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hps5P59438 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hps5P59438 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hps5P59438 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hps5P59438 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hps5P59438 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hps5P59438 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hps5P59438 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hps5P59438 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hps5P59438 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hps5P59438 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hps5P59438 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hps5P59438 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hps5P59438 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hps5P59438 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Hps5P59438 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hps5P59438 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hps5P59438 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hps5P59438 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hps5P59438 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hps5P59438 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.8 ms