Protein–RNA interactions for Protein: P59034

Lrrc3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc3P59034 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc3P59034 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc3P59034 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc3P59034 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc3P59034 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc3P59034 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc3P59034 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc3P59034 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc3P59034 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc3P59034 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc3P59034 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc3P59034 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc3P59034 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc3P59034 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc3P59034 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc3P59034 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc3P59034 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc3P59034 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc3P59034 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc3P59034 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc3P59034 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc3P59034 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc3P59034 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc3P59034 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc3P59034 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc3P59034 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc3P59034 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms