Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm1P58771 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpm1P58771 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpm1P58771 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpm1P58771 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpm1P58771 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm1P58771 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpm1P58771 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpm1P58771 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpm1P58771 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tpm1P58771 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm1P58771 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm1P58771 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tpm1P58771 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tpm1P58771 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tpm1P58771 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tpm1P58771 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm1P58771 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm1P58771 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm1P58771 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm1P58771 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm1P58771 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm1P58771 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm1P58771 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms