Protein–RNA interactions for Protein: P58406

Hrh3, Histamine H3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh3P58406 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hrh3P58406 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hrh3P58406 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hrh3P58406 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hrh3P58406 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hrh3P58406 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hrh3P58406 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms