Protein–RNA interactions for Protein: P58196

Plscr4, Phospholipid scramblase 4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plscr4P58196 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plscr4P58196 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plscr4P58196 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plscr4P58196 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plscr4P58196 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plscr4P58196 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plscr4P58196 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Plscr4P58196 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Plscr4P58196 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Plscr4P58196 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plscr4P58196 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Plscr4P58196 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plscr4P58196 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms