Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp25P57080 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp25P57080 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp25P57080 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp25P57080 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp25P57080 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp25P57080 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp25P57080 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp25P57080 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp25P57080 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp25P57080 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp25P57080 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Usp25P57080 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp25P57080 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp25P57080 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp25P57080 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp25P57080 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp25P57080 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp25P57080 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp25P57080 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp25P57080 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp25P57080 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp25P57080 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp25P57080 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp25P57080 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp25P57080 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp25P57080 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp25P57080 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp25P57080 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp25P57080 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp25P57080 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp25P57080 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp25P57080 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp25P57080 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp25P57080 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp25P57080 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp25P57080 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp25P57080 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp25P57080 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Usp25P57080 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp25P57080 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp25P57080 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp25P57080 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp25P57080 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp25P57080 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp25P57080 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp25P57080 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp25P57080 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp25P57080 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp25P57080 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp25P57080 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp25P57080 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp25P57080 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms