Protein–RNA interactions for Protein: P56404

Aqp8, Aquaporin-8, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp8P56404 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aqp8P56404 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aqp8P56404 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aqp8P56404 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aqp8P56404 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aqp8P56404 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.3 ms