Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox7bP56393 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cox7bP56393 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cox7bP56393 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox7bP56393 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox7bP56393 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms