Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fdft1P53798 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fdft1P53798 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fdft1P53798 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fdft1P53798 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fdft1P53798 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fdft1P53798 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fdft1P53798 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fdft1P53798 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fdft1P53798 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fdft1P53798 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fdft1P53798 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fdft1P53798 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fdft1P53798 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fdft1P53798 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fdft1P53798 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fdft1P53798 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fdft1P53798 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fdft1P53798 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fdft1P53798 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms