Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TspoP50637 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TspoP50637 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TspoP50637 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TspoP50637 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TspoP50637 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TspoP50637 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TspoP50637 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TspoP50637 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TspoP50637 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TspoP50637 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TspoP50637 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TspoP50637 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TspoP50637 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TspoP50637 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TspoP50637 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TspoP50637 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TspoP50637 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TspoP50637 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TspoP50637 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TspoP50637 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TspoP50637 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TspoP50637 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TspoP50637 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TspoP50637 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TspoP50637 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TspoP50637 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TspoP50637 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TspoP50637 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TspoP50637 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TspoP50637 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TspoP50637 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TspoP50637 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TspoP50637 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TspoP50637 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TspoP50637 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TspoP50637 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TspoP50637 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TspoP50637 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TspoP50637 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TspoP50637 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TspoP50637 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TspoP50637 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TspoP50637 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TspoP50637 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TspoP50637 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TspoP50637 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TspoP50637 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TspoP50637 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TspoP50637 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TspoP50637 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TspoP50637 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TspoP50637 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TspoP50637 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TspoP50637 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TspoP50637 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TspoP50637 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TspoP50637 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TspoP50637 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TspoP50637 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TspoP50637 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TspoP50637 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TspoP50637 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TspoP50637 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TspoP50637 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TspoP50637 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TspoP50637 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TspoP50637 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TspoP50637 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TspoP50637 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TspoP50637 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TspoP50637 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TspoP50637 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TspoP50637 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TspoP50637 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TspoP50637 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TspoP50637 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TspoP50637 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TspoP50637 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TspoP50637 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TspoP50637 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TspoP50637 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TspoP50637 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TspoP50637 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TspoP50637 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TspoP50637 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TspoP50637 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TspoP50637 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TspoP50637 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TspoP50637 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TspoP50637 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TspoP50637 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TspoP50637 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TspoP50637 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TspoP50637 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TspoP50637 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TspoP50637 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TspoP50637 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TspoP50637 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TspoP50637 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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