Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbp3P49194 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbp3P49194 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbp3P49194 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbp3P49194 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbp3P49194 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbp3P49194 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbp3P49194 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbp3P49194 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbp3P49194 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbp3P49194 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rbp3P49194 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rbp3P49194 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rbp3P49194 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbp3P49194 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rbp3P49194 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbp3P49194 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbp3P49194 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbp3P49194 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbp3P49194 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbp3P49194 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbp3P49194 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbp3P49194 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbp3P49194 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rbp3P49194 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbp3P49194 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbp3P49194 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbp3P49194 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbp3P49194 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms