Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scg3P47867 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scg3P47867 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scg3P47867 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scg3P47867 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg3P47867 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scg3P47867 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scg3P47867 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scg3P47867 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scg3P47867 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scg3P47867 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scg3P47867 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scg3P47867 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg3P47867 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg3P47867 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg3P47867 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scg3P47867 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg3P47867 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg3P47867 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scg3P47867 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scg3P47867 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scg3P47867 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg3P47867 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scg3P47867 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scg3P47867 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scg3P47867 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scg3P47867 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scg3P47867 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms