Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PfkmP47857 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PfkmP47857 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PfkmP47857 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PfkmP47857 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PfkmP47857 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PfkmP47857 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PfkmP47857 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PfkmP47857 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PfkmP47857 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PfkmP47857 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PfkmP47857 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PfkmP47857 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PfkmP47857 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PfkmP47857 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PfkmP47857 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PfkmP47857 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PfkmP47857 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PfkmP47857 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PfkmP47857 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PfkmP47857 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PfkmP47857 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PfkmP47857 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PfkmP47857 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PfkmP47857 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PfkmP47857 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PfkmP47857 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PfkmP47857 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PfkmP47857 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PfkmP47857 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PfkmP47857 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PfkmP47857 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PfkmP47857 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PfkmP47857 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PfkmP47857 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PfkmP47857 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PfkmP47857 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PfkmP47857 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms