Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
InaP46660 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
InaP46660 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
InaP46660 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
InaP46660 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
InaP46660 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
InaP46660 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
InaP46660 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
InaP46660 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
InaP46660 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
InaP46660 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
InaP46660 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
InaP46660 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
InaP46660 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
InaP46660 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
InaP46660 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
InaP46660 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
InaP46660 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
InaP46660 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
InaP46660 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
InaP46660 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
InaP46660 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
InaP46660 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
InaP46660 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
InaP46660 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
InaP46660 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
InaP46660 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
InaP46660 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
InaP46660 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
InaP46660 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
InaP46660 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
InaP46660 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
InaP46660 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
InaP46660 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
InaP46660 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
InaP46660 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
InaP46660 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
InaP46660 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
InaP46660 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
InaP46660 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
InaP46660 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
InaP46660 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
InaP46660 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
InaP46660 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
InaP46660 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
InaP46660 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
InaP46660 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
InaP46660 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
InaP46660 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
InaP46660 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
InaP46660 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
InaP46660 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
InaP46660 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
InaP46660 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
InaP46660 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
InaP46660 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
InaP46660 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
InaP46660 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
InaP46660 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
InaP46660 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
InaP46660 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
InaP46660 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
InaP46660 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
InaP46660 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
InaP46660 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
InaP46660 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
InaP46660 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
InaP46660 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
InaP46660 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
InaP46660 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
InaP46660 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
InaP46660 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
InaP46660 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
InaP46660 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
InaP46660 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
InaP46660 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
InaP46660 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
InaP46660 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
InaP46660 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
InaP46660 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
InaP46660 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
InaP46660 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
InaP46660 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
InaP46660 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
InaP46660 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
InaP46660 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
InaP46660 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
InaP46660 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
InaP46660 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
InaP46660 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
InaP46660 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
InaP46660 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
InaP46660 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
InaP46660 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
InaP46660 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
InaP46660 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
InaP46660 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
InaP46660 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
InaP46660 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
InaP46660 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms