Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ItgavP43406 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ItgavP43406 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ItgavP43406 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ItgavP43406 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ItgavP43406 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ItgavP43406 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ItgavP43406 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ItgavP43406 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ItgavP43406 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ItgavP43406 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ItgavP43406 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ItgavP43406 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItgavP43406 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItgavP43406 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItgavP43406 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItgavP43406 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ItgavP43406 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ItgavP43406 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ItgavP43406 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ItgavP43406 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ItgavP43406 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ItgavP43406 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ItgavP43406 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ItgavP43406 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ItgavP43406 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ItgavP43406 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ItgavP43406 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ItgavP43406 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ItgavP43406 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ItgavP43406 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ItgavP43406 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ItgavP43406 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ItgavP43406 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ItgavP43406 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ItgavP43406 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ItgavP43406 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ItgavP43406 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ItgavP43406 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ItgavP43406 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ItgavP43406 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ItgavP43406 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ItgavP43406 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ItgavP43406 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ItgavP43406 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ItgavP43406 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ItgavP43406 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ItgavP43406 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms