Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlx1P43345 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlx1P43345 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlx1P43345 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlx1P43345 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlx1P43345 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlx1P43345 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlx1P43345 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlx1P43345 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlx1P43345 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlx1P43345 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tlx1P43345 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlx1P43345 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlx1P43345 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlx1P43345 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlx1P43345 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlx1P43345 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlx1P43345 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlx1P43345 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlx1P43345 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlx1P43345 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlx1P43345 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlx1P43345 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tlx1P43345 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlx1P43345 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlx1P43345 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlx1P43345 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlx1P43345 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlx1P43345 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlx1P43345 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlx1P43345 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlx1P43345 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlx1P43345 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlx1P43345 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlx1P43345 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlx1P43345 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlx1P43345 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlx1P43345 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlx1P43345 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlx1P43345 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlx1P43345 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tlx1P43345 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlx1P43345 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlx1P43345 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlx1P43345 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlx1P43345 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlx1P43345 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlx1P43345 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlx1P43345 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlx1P43345 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlx1P43345 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlx1P43345 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms