Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pola2P33611 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pola2P33611 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pola2P33611 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pola2P33611 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pola2P33611 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola2P33611 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pola2P33611 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pola2P33611 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pola2P33611 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pola2P33611 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pola2P33611 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola2P33611 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pola2P33611 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pola2P33611 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pola2P33611 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pola2P33611 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola2P33611 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pola2P33611 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pola2P33611 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pola2P33611 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pola2P33611 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pola2P33611 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pola2P33611 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola2P33611 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola2P33611 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola2P33611 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pola2P33611 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pola2P33611 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pola2P33611 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pola2P33611 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola2P33611 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pola2P33611 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola2P33611 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pola2P33611 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pola2P33611 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms