Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdh15P33146 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdh15P33146 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdh15P33146 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdh15P33146 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdh15P33146 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdh15P33146 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdh15P33146 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdh15P33146 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdh15P33146 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdh15P33146 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdh15P33146 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdh15P33146 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Cdh15P33146 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdh15P33146 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdh15P33146 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdh15P33146 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdh15P33146 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdh15P33146 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdh15P33146 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdh15P33146 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdh15P33146 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdh15P33146 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdh15P33146 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdh15P33146 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdh15P33146 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdh15P33146 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdh15P33146 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdh15P33146 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdh15P33146 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms