Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,28■■□□□ 1
Cd28P31041 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Cd28P31041 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Cd28P31041 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Cd28P31041 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Cd28P31041 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Cd28P31041 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Cd28P31041 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Cd28P31041 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,2■□□□□ 0,98
Cd28P31041 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Cd28P31041 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Cd28P31041 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Cd28P31041 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,17■□□□□ 0,98
Cd28P31041 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Cd28P31041 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Cd28P31041 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Cd28P31041 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Cd28P31041 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Cd28P31041 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Cd28P31041 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21,09■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Cd28P31041 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Cd28P31041 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Cd28P31041 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Cd28P31041 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cd28P31041 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cd28P31041 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cd28P31041 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cd28P31041 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cd28P31041 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Cd28P31041 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Cd28P31041 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Cd28P31041 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Cd28P31041 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Cd28P31041 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Cd28P31041 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Cd28P31041 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Cd28P31041 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
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