Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kif3aP28741 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif3aP28741 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif3aP28741 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kif3aP28741 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kif3aP28741 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kif3aP28741 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kif3aP28741 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kif3aP28741 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kif3aP28741 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kif3aP28741 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kif3aP28741 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Kif3aP28741 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kif3aP28741 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kif3aP28741 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kif3aP28741 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kif3aP28741 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kif3aP28741 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kif3aP28741 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Kif3aP28741 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kif3aP28741 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kif3aP28741 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kif3aP28741 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Kif3aP28741 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kif3aP28741 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kif3aP28741 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Kif3aP28741 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kif3aP28741 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms