Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gabra3P26049 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabra3P26049 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabra3P26049 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabra3P26049 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gabra3P26049 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabra3P26049 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabra3P26049 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabra3P26049 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabra3P26049 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabra3P26049 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabra3P26049 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabra3P26049 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabra3P26049 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabra3P26049 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabra3P26049 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabra3P26049 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabra3P26049 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabra3P26049 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabra3P26049 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabra3P26049 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabra3P26049 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabra3P26049 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabra3P26049 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gabra3P26049 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gabra3P26049 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gabra3P26049 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabra3P26049 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabra3P26049 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabra3P26049 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabra3P26049 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabra3P26049 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabra3P26049 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabra3P26049 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabra3P26049 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra3P26049 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra3P26049 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra3P26049 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra3P26049 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra3P26049 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms