Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccnd1P25322 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccnd1P25322 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnd1P25322 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnd1P25322 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms