Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NdnP25233 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NdnP25233 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NdnP25233 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NdnP25233 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NdnP25233 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NdnP25233 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NdnP25233 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NdnP25233 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NdnP25233 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NdnP25233 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NdnP25233 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NdnP25233 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NdnP25233 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NdnP25233 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NdnP25233 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NdnP25233 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NdnP25233 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NdnP25233 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NdnP25233 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NdnP25233 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NdnP25233 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NdnP25233 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NdnP25233 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NdnP25233 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NdnP25233 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NdnP25233 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NdnP25233 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NdnP25233 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NdnP25233 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NdnP25233 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NdnP25233 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NdnP25233 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NdnP25233 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NdnP25233 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NdnP25233 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NdnP25233 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NdnP25233 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NdnP25233 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NdnP25233 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NdnP25233 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NdnP25233 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NdnP25233 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NdnP25233 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NdnP25233 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NdnP25233 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NdnP25233 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NdnP25233 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NdnP25233 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NdnP25233 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NdnP25233 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NdnP25233 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NdnP25233 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NdnP25233 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NdnP25233 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NdnP25233 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NdnP25233 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NdnP25233 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NdnP25233 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NdnP25233 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NdnP25233 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NdnP25233 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NdnP25233 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NdnP25233 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NdnP25233 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NdnP25233 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NdnP25233 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NdnP25233 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NdnP25233 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NdnP25233 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NdnP25233 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NdnP25233 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NdnP25233 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NdnP25233 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NdnP25233 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NdnP25233 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NdnP25233 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NdnP25233 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NdnP25233 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NdnP25233 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NdnP25233 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NdnP25233 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NdnP25233 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NdnP25233 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NdnP25233 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NdnP25233 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NdnP25233 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NdnP25233 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NdnP25233 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NdnP25233 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NdnP25233 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NdnP25233 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NdnP25233 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NdnP25233 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NdnP25233 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NdnP25233 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NdnP25233 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NdnP25233 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NdnP25233 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NdnP25233 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms