Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf239P24399 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf239P24399 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf239P24399 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf239P24399 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf239P24399 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf239P24399 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf239P24399 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf239P24399 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf239P24399 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf239P24399 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf239P24399 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf239P24399 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf239P24399 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf239P24399 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf239P24399 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf239P24399 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf239P24399 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf239P24399 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf239P24399 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf239P24399 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf239P24399 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf239P24399 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms