Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxd11P23813 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hoxd11P23813 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hoxd11P23813 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Hoxd11P23813 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxd11P23813 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxd11P23813 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxd11P23813 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hoxd11P23813 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxd11P23813 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxd11P23813 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hoxd11P23813 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms