Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NfyaP23708 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfyaP23708 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfyaP23708 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfyaP23708 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NfyaP23708 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfyaP23708 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NfyaP23708 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NfyaP23708 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NfyaP23708 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NfyaP23708 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms