Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpcP21841 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpcP21841 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpcP21841 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpcP21841 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpcP21841 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpcP21841 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpcP21841 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpcP21841 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpcP21841 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpcP21841 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SftpcP21841 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SftpcP21841 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SftpcP21841 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SftpcP21841 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpcP21841 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpcP21841 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpcP21841 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpcP21841 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpcP21841 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SftpcP21841 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SftpcP21841 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SftpcP21841 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SftpcP21841 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SftpcP21841 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SftpcP21841 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SftpcP21841 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SftpcP21841 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SftpcP21841 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SftpcP21841 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SftpcP21841 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpcP21841 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpcP21841 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpcP21841 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpcP21841 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpcP21841 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpcP21841 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpcP21841 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpcP21841 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpcP21841 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpcP21841 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SftpcP21841 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SftpcP21841 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpcP21841 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpcP21841 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpcP21841 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SftpcP21841 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SftpcP21841 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SftpcP21841 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SftpcP21841 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SftpcP21841 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SftpcP21841 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms