Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klra1P20937 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klra1P20937 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klra1P20937 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klra1P20937 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klra1P20937 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klra1P20937 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klra1P20937 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klra1P20937 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klra1P20937 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klra1P20937 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klra1P20937 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klra1P20937 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klra1P20937 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Klra1P20937 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klra1P20937 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klra1P20937 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klra1P20937 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klra1P20937 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klra1P20937 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klra1P20937 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klra1P20937 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klra1P20937 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klra1P20937 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klra1P20937 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klra1P20937 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klra1P20937 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klra1P20937 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klra1P20937 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klra1P20937 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Klra1P20937 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klra1P20937 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klra1P20937 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klra1P20937 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klra1P20937 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klra1P20937 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klra1P20937 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Klra1P20937 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klra1P20937 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klra1P20937 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klra1P20937 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klra1P20937 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klra1P20937 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klra1P20937 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Klra1P20937 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klra1P20937 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klra1P20937 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klra1P20937 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klra1P20937 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klra1P20937 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klra1P20937 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klra1P20937 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klra1P20937 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klra1P20937 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms