Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SagP20443 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SagP20443 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SagP20443 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SagP20443 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SagP20443 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SagP20443 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SagP20443 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SagP20443 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SagP20443 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SagP20443 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SagP20443 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SagP20443 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SagP20443 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SagP20443 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SagP20443 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SagP20443 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SagP20443 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SagP20443 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SagP20443 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SagP20443 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SagP20443 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SagP20443 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SagP20443 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SagP20443 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SagP20443 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SagP20443 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SagP20443 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SagP20443 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SagP20443 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SagP20443 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SagP20443 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SagP20443 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SagP20443 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SagP20443 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SagP20443 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SagP20443 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SagP20443 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SagP20443 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SagP20443 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SagP20443 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SagP20443 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SagP20443 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SagP20443 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SagP20443 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SagP20443 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SagP20443 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SagP20443 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SagP20443 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SagP20443 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SagP20443 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SagP20443 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SagP20443 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SagP20443 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SagP20443 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SagP20443 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SagP20443 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SagP20443 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SagP20443 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SagP20443 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SagP20443 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SagP20443 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SagP20443 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SagP20443 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SagP20443 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SagP20443 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SagP20443 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SagP20443 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SagP20443 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SagP20443 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SagP20443 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SagP20443 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SagP20443 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SagP20443 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SagP20443 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SagP20443 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SagP20443 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SagP20443 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SagP20443 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SagP20443 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SagP20443 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SagP20443 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SagP20443 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SagP20443 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SagP20443 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SagP20443 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SagP20443 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SagP20443 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SagP20443 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SagP20443 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SagP20443 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SagP20443 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SagP20443 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SagP20443 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SagP20443 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SagP20443 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SagP20443 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SagP20443 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SagP20443 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SagP20443 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms