Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lama1P19137 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lama1P19137 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama1P19137 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama1P19137 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lama1P19137 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lama1P19137 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama1P19137 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lama1P19137 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lama1P19137 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lama1P19137 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama1P19137 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama1P19137 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama1P19137 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama1P19137 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama1P19137 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama1P19137 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama1P19137 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama1P19137 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama1P19137 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama1P19137 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama1P19137 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama1P19137 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lama1P19137 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lama1P19137 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lama1P19137 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama1P19137 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama1P19137 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama1P19137 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lama1P19137 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama1P19137 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lama1P19137 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lama1P19137 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lama1P19137 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lama1P19137 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama1P19137 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama1P19137 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama1P19137 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama1P19137 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama1P19137 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms