Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka3P18654 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka3P18654 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps6ka3P18654 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka3P18654 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps6ka3P18654 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps6ka3P18654 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps6ka3P18654 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps6ka3P18654 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rps6ka3P18654 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps6ka3P18654 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps6ka3P18654 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6ka3P18654 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rps6ka3P18654 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms