Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rag1P15919 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rag1P15919 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rag1P15919 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rag1P15919 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rag1P15919 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rag1P15919 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rag1P15919 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rag1P15919 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rag1P15919 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rag1P15919 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rag1P15919 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rag1P15919 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rag1P15919 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rag1P15919 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rag1P15919 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rag1P15919 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rag1P15919 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rag1P15919 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rag1P15919 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms