Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrphP15331 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrphP15331 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PrphP15331 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrphP15331 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrphP15331 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrphP15331 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PrphP15331 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrphP15331 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrphP15331 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrphP15331 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrphP15331 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrphP15331 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrphP15331 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrphP15331 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrphP15331 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PrphP15331 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrphP15331 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PrphP15331 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PrphP15331 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrphP15331 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrphP15331 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrphP15331 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrphP15331 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrphP15331 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PrphP15331 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrphP15331 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrphP15331 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrphP15331 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrphP15331 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PrphP15331 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrphP15331 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrphP15331 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PrphP15331 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrphP15331 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrphP15331 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrphP15331 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrphP15331 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrphP15331 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrphP15331 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrphP15331 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrphP15331 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrphP15331 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrphP15331 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrphP15331 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrphP15331 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrphP15331 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrphP15331 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrphP15331 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrphP15331 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrphP15331 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrphP15331 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrphP15331 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrphP15331 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrphP15331 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrphP15331 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrphP15331 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrphP15331 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrphP15331 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrphP15331 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrphP15331 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrphP15331 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrphP15331 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PrphP15331 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrphP15331 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PrphP15331 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrphP15331 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrphP15331 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrphP15331 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrphP15331 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrphP15331 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrphP15331 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrphP15331 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrphP15331 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrphP15331 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrphP15331 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrphP15331 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PrphP15331 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrphP15331 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrphP15331 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrphP15331 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrphP15331 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PrphP15331 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrphP15331 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrphP15331 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrphP15331 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrphP15331 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrphP15331 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrphP15331 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrphP15331 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PrphP15331 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrphP15331 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrphP15331 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrphP15331 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrphP15331 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrphP15331 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrphP15331 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrphP15331 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrphP15331 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrphP15331 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms