Protein–RNA interactions for Protein: P13439

Umps, Uridine 5'-monophosphate synthase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UmpsP13439 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UmpsP13439 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UmpsP13439 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UmpsP13439 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UmpsP13439 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UmpsP13439 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UmpsP13439 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UmpsP13439 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UmpsP13439 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UmpsP13439 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UmpsP13439 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UmpsP13439 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UmpsP13439 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UmpsP13439 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UmpsP13439 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UmpsP13439 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UmpsP13439 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UmpsP13439 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UmpsP13439 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UmpsP13439 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UmpsP13439 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UmpsP13439 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UmpsP13439 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UmpsP13439 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UmpsP13439 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UmpsP13439 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UmpsP13439 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UmpsP13439 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UmpsP13439 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms