Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Parp1P11103 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Parp1P11103 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Parp1P11103 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Parp1P11103 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Parp1P11103 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Parp1P11103 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Parp1P11103 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Parp1P11103 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Parp1P11103 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Parp1P11103 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Parp1P11103 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Parp1P11103 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Parp1P11103 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Parp1P11103 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Parp1P11103 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Parp1P11103 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Parp1P11103 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Parp1P11103 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Parp1P11103 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Parp1P11103 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Parp1P11103 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Parp1P11103 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Parp1P11103 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Parp1P11103 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Parp1P11103 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Parp1P11103 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Parp1P11103 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Parp1P11103 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Parp1P11103 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Parp1P11103 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Parp1P11103 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Parp1P11103 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Parp1P11103 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Parp1P11103 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Parp1P11103 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Parp1P11103 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Parp1P11103 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Parp1P11103 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Parp1P11103 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Parp1P11103 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Parp1P11103 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Parp1P11103 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Parp1P11103 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Parp1P11103 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Parp1P11103 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Parp1P11103 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Parp1P11103 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Parp1P11103 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Parp1P11103 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Parp1P11103 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Parp1P11103 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Parp1P11103 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Parp1P11103 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Parp1P11103 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Parp1P11103 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Parp1P11103 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms