Protein–RNA interactions for Protein: P08730

Krt13, Keratin, type I cytoskeletal 13, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt13P08730 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt13P08730 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt13P08730 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt13P08730 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt13P08730 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt13P08730 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt13P08730 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt13P08730 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt13P08730 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt13P08730 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt13P08730 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt13P08730 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt13P08730 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt13P08730 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt13P08730 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt13P08730 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Krt13P08730 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt13P08730 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt13P08730 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt13P08730 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt13P08730 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt13P08730 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt13P08730 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt13P08730 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt13P08730 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt13P08730 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt13P08730 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt13P08730 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt13P08730 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt13P08730 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt13P08730 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt13P08730 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt13P08730 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt13P08730 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt13P08730 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt13P08730 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt13P08730 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt13P08730 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Krt13P08730 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt13P08730 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt13P08730 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt13P08730 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt13P08730 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt13P08730 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt13P08730 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt13P08730 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt13P08730 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt13P08730 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt13P08730 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt13P08730 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt13P08730 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt13P08730 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms