Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifna5P07349 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifna5P07349 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifna5P07349 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ifna5P07349 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifna5P07349 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms