Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gh1P06880 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gh1P06880 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gh1P06880 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gh1P06880 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gh1P06880 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gh1P06880 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gh1P06880 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gh1P06880 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gh1P06880 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gh1P06880 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gh1P06880 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gh1P06880 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gh1P06880 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gh1P06880 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gh1P06880 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gh1P06880 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gh1P06880 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gh1P06880 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gh1P06880 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gh1P06880 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gh1P06880 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gh1P06880 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gh1P06880 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gh1P06880 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gh1P06880 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gh1P06880 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gh1P06880 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gh1P06880 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gh1P06880 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gh1P06880 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gh1P06880 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gh1P06880 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gh1P06880 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gh1P06880 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gh1P06880 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gh1P06880 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gh1P06880 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gh1P06880 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gh1P06880 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gh1P06880 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gh1P06880 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gh1P06880 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gh1P06880 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gh1P06880 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gh1P06880 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gh1P06880 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gh1P06880 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gh1P06880 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gh1P06880 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gh1P06880 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms